ישיבת אמי"ת נחשון מטה יהודה היא זוכת פרס החינוך הדתי לשנת תשע"ט, כך פרסם משרד החינוך, וזאת בשל הישגים חינוכיים ולימודיים משמעותיים. את ההודעה על הזכייה קיבל ראש הישיבה הרב נעם קריגמן, מראש מנהל החמ"ד, הרב ד"ר אברהם ליפשיץ. ישיבת אמי"ת נחשון מטה יהודה מובילה בשנים האחרונות תכנית חדשנית - "פרדס", ללמידה שכבתית ורב תחומית ושיטות למידה מגוונות וחדשניות הן במקצועות הקודש והן במקצועות החול. בבית החינוך שמים דגש משמעותי על העצמה אישית של כל תלמיד בתכנית אסטרטגית שש שנתית.